Bacia Hidrográfica do Rio Sergipe ocupa uma área total de 3.753,81 km². Uma pequena porção de sua área de drenagem está inserida no estado da Bahia, o restante (3.672,62 km²) corresponde à aproximadamente 16,8 % do espaço territorial do estado de Sergipe.

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Nos tramos alto e em parte do médio da bacia, por sofrer influência do clima Semiárido, os cursos d’águas são intermitentes, inviabilizando, praticamente, o atendimento das demandas hídricas relacionadas aos diversos usos. Após Nossa Senhora das Dores, os escoamentos tornam-se perenes.

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Por abrigar grande parte da Região Metropolitana de Aracaju, os recursos hídricos superficiais da bacia são bastante requeridos para o atendimento da demanda relativa ao abastecimentos público. Além destes usos, sobressaem as demandas relacionadas à irrigação, tanto em perímetros públicos, como em áreas particulares, seguidas das atividade de aquicultura, desenvolvida no estuário, e abastecimento industrial.